Vlada Hercegovačko-neretvanskog kantona nosilac je izvršne vlasti u skladu s Ustavom HNK i ima četverogodišnji mandat. Vladu čine ministarstva (Ministarstvo saobraćaja i veza, Ministarstvo finansija, Ministarstvo unutrašnjih poslova, Ministarstvo privrede, Ministarstvo poljoprivrede, šumarstva i vodoprivrede, Ministarstvo građenja i prostornog uređenja, Ministarstvo zdravstva, rada i socijalne zaštite, Ministarstvo obrazovanja, nauke, kulture i sporta, Ministarstvo pravosuđa, uprave i lokalne samouprave, Ministarstvo trgovine, turizma i zaštite okoliša, Ministarstvo za pitanja boraca). Na čelu Vlade je predsjednik, koji rukovodi radom Vlade.